Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms