Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms