Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pola2P33611 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pola2P33611 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms