Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms