Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc11P31313 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms