Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms