Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms