Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif5cP28738 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms