Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RxraP28700 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RxraP28700 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RxraP28700 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RxraP28700 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RxraP28700 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RxraP28700 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RxraP28700 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
RxraP28700 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms