Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms