Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vav1P27870 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vav1P27870 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms