Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarsP26638 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarsP26638 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarsP26638 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarsP26638 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SarsP26638 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarsP26638 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarsP26638 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarsP26638 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms