Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af2P26369 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms