Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou2f1P25425 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms