Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms