Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms