Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc2P20801 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc2P20801 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms