Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms