Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms