Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP20293 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TP20293 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TP20293 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TP20293 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP20293 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TP20293 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP20293 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP20293 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP20293 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms