Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou5f1P20263 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms