Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trap1aP19473 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trap1aP19473 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms