Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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