Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn1s1P19228 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms