Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18529 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18529 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18529 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18529 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18529 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18529 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18529 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18529 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18529 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18529 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18529 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms