Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra6P16305 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms