Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp53P15975 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp53P15975 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp53P15975 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms