Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms