Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrphP15331 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrphP15331 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrphP15331 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrphP15331 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrphP15331 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrphP15331 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrphP15331 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrphP15331 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrphP15331 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrphP15331 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrphP15331 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrphP15331 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrphP15331 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrphP15331 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrphP15331 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrphP15331 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrphP15331 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrphP15331 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrphP15331 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrphP15331 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrphP15331 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrphP15331 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms