Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FosbP13346 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FosbP13346 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FosbP13346 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FosbP13346 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FosbP13346 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FosbP13346 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosbP13346 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FosbP13346 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms