Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms