Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DmdP11531 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DmdP11531 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DmdP11531 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DmdP11531 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DmdP11531 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DmdP11531 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DmdP11531 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DmdP11531 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DmdP11531 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DmdP11531 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DmdP11531 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DmdP11531 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DmdP11531 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms