Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spp1P10923 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spp1P10923 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spp1P10923 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spp1P10923 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms