Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P10404 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P10404 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P10404 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P10404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P10404 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P10404 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P10404 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms