Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb4P10284 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms