Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms