Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calm3P0DP28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calm3P0DP28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms