Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb2P0C1T1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms