Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms