Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa5P09021 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa5P09021 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms