Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ApoeP08226 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms