Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Egr1P08046 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms