Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PtprcP06800 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprcP06800 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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