Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-T23P06339 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-T23P06339 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms