Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JunP05627 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JunP05627 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JunP05627 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JunP05627 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JunP05627 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JunP05627 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
JunP05627 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JunP05627 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JunP05627 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JunP05627 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JunP05627 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JunP05627 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JunP05627 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JunP05627 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JunP05627 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JunP05627 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms