Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa2P05367 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa2P05367 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa2P05367 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa2P05367 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms