Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt1P04104 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms