Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B2mP01887 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B2mP01887 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B2mP01887 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B2mP01887 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B2mP01887 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B2mP01887 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B2mP01887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B2mP01887 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms