Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01803 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01803 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01803 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01803 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01803 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01803 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01803 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms