Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01790 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01790 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01790 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01790 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01790 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01790 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01790 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01790 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01790 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01790 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01790 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P01790 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01790 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01790 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01790 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01790 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01790 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01790 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms